185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2903 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  100 
 
 		 488 aa  980    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  77.22 
 
 		 487 aa  761    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  54.87 
 
 		 492 aa  532  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  56.79 
 
 		 488 aa  530  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  51.9 
 
 		 501 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  50.21 
 
 		 486 aa  478  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  53.22 
 
 		 478 aa  468  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  46.69 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  30.37 
 
 		 501 aa  160  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  28.11 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  27.36 
 
 		 467 aa  147  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 472 aa  143  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  25.26 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.99 
 
 		 479 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  26.42 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.16 
 
 		 542 aa  134  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  25.45 
 
 		 526 aa  134  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  26.89 
 
 		 533 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  28.33 
 
 		 489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  25.32 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  25.71 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  23.7 
 
 		 502 aa  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.22 
 
 		 892 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  27.99 
 
 		 568 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.18 
 
 		 509 aa  106  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.13 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  25.11 
 
 		 513 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  25.27 
 
 		 513 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  23.79 
 
 		 517 aa  97.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  23.63 
 
 		 547 aa  95.1  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  24.44 
 
 		 566 aa  94.7  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  23.97 
 
 		 523 aa  94  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  25 
 
 		 498 aa  93.6  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  25 
 
 		 498 aa  93.6  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  25 
 
 		 498 aa  93.6  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  25 
 
 		 498 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  25.62 
 
 		 509 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  25.24 
 
 		 566 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  23.18 
 
 		 522 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  23.18 
 
 		 505 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  23.37 
 
 		 581 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  23.18 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  23.87 
 
 		 562 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  25 
 
 		 581 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  26.05 
 
 		 527 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  21.57 
 
 		 883 aa  86.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  22.86 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.94 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.94 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.15 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.46 
 
 		 533 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.29 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  23.72 
 
 		 592 aa  77.4  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  23.22 
 
 		 551 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  25.06 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  24.92 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  22.29 
 
 		 598 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  23.05 
 
 		 565 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  24.24 
 
 		 523 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  22.93 
 
 		 570 aa  70.5  0.00000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  24.55 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.03 
 
 		 526 aa  69.7  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  23.14 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  23.74 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  29.5 
 
 		 565 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.51 
 
 		 613 aa  62.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  22.73 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  25.31 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.48 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.61 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.3 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.42 
 
 		 548 aa  60.1  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24.58 
 
 		 569 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  21.67 
 
 		 575 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.16 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.72 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.98 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  24.54 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.28 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  23.17 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  21.98 
 
 		 520 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  23.56 
 
 		 529 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  22.81 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.67 
 
 		 567 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.41 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.97 
 
 		 593 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  23.74 
 
 		 683 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  25.53 
 
 		 529 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  22.13 
 
 		 520 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.13 
 
 		 520 aa  53.5  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  21.64 
 
 		 618 aa  53.5  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1600  Na+/solute symporter  24.86 
 
 		 473 aa  53.5  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0101485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.1 
 
 		 461 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  23.53 
 
 		 564 aa  53.5  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  22.66 
 
 		 688 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.9 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  21.91 
 
 		 460 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.38 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.79 
 
 		 526 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>