175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1047 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  100 
 
 		 488 aa  979    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  57.2 
 
 		 487 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  56.3 
 
 		 488 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  48.21 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  50.52 
 
 		 492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  49.48 
 
 		 478 aa  435  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  43.92 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  44.38 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  28.81 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  27.74 
 
 		 526 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  29.13 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  26.79 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  26.46 
 
 		 468 aa  140  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  27.14 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  27.14 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  25.45 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  25.5 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  27.81 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.87 
 
 		 479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.61 
 
 		 542 aa  130  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  26.03 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  27.61 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  27.56 
 
 		 530 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  25.74 
 
 		 568 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.79 
 
 		 574 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  27.33 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  25.35 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  24.71 
 
 		 517 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  28.07 
 
 		 509 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  23.93 
 
 		 547 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.67 
 
 		 513 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  23.44 
 
 		 502 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  23.81 
 
 		 581 aa  96.7  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  22.69 
 
 		 523 aa  95.9  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  26.1 
 
 		 566 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  27.65 
 
 		 527 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  23.08 
 
 		 883 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  23.08 
 
 		 557 aa  93.6  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 566 aa  93.6  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.68 
 
 		 526 aa  93.2  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.46 
 
 		 509 aa  92.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  25.34 
 
 		 529 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  23.06 
 
 		 557 aa  89.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  22.65 
 
 		 505 aa  87  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  23.69 
 
 		 522 aa  86.7  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  23.3 
 
 		 562 aa  83.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  21.97 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  25.84 
 
 		 527 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  21.79 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  21.79 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  21.79 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  21.79 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  22.7 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  24.01 
 
 		 565 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.31 
 
 		 892 aa  77  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  22.76 
 
 		 551 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.13 
 
 		 523 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.91 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.91 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.93 
 
 		 565 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.22 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  22.22 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  23.14 
 
 		 592 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  24.08 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  21.95 
 
 		 570 aa  64.7  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  23.84 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.85 
 
 		 548 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  22.2 
 
 		 520 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.72 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  25.23 
 
 		 560 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  23.34 
 
 		 598 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.6 
 
 		 519 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.06 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  22.72 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  25.78 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.19 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  26.18 
 
 		 564 aa  57  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  22.33 
 
 		 529 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.97 
 
 		 522 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  26.85 
 
 		 565 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  22.64 
 
 		 765 aa  54.7  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  23.47 
 
 		 571 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  20.44 
 
 		 474 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.64 
 
 		 526 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  20.92 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  23.47 
 
 		 571 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  23.47 
 
 		 571 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  23.47 
 
 		 571 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  23.47 
 
 		 571 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.76 
 
 		 567 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  22.96 
 
 		 571 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  22.96 
 
 		 520 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  25.09 
 
 		 562 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.55 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.56 
 
 		 561 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.97 
 
 		 520 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  21.72 
 
 		 671 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  23.48 
 
 		 683 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.43 
 
 		 522 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.96 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>