More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0416 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  100 
 
 
570 aa  1123    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.05 
 
 
510 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.05 
 
 
510 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  36.59 
 
 
509 aa  323  4e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.62 
 
 
892 aa  279  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  38.33 
 
 
498 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  38.33 
 
 
498 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  38.33 
 
 
498 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  38.33 
 
 
498 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  35.22 
 
 
505 aa  257  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  33.2 
 
 
883 aa  257  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  34.57 
 
 
505 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  32.15 
 
 
527 aa  221  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  32.33 
 
 
529 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  30.13 
 
 
527 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  28.41 
 
 
522 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.85 
 
 
542 aa  150  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  26.46 
 
 
526 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  30.58 
 
 
472 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  29.93 
 
 
472 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  26.38 
 
 
520 aa  120  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  27.72 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  22.14 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.15 
 
 
533 aa  115  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  25.49 
 
 
551 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  27.71 
 
 
513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  26.39 
 
 
501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.51 
 
 
526 aa  114  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.73 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  24.07 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.11 
 
 
522 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.43 
 
 
565 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  27.79 
 
 
468 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  30.32 
 
 
523 aa  107  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  23.62 
 
 
592 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  24.47 
 
 
581 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  23.19 
 
 
489 aa  103  8e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  23.79 
 
 
509 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.27 
 
 
479 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.14 
 
 
520 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.99 
 
 
523 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  23.56 
 
 
557 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  25.2 
 
 
468 aa  102  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  23.09 
 
 
557 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  28.04 
 
 
470 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.96 
 
 
548 aa  101  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.2 
 
 
522 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.09 
 
 
520 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.29 
 
 
551 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.48 
 
 
574 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.86 
 
 
520 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.57 
 
 
519 aa  97.8  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  23.05 
 
 
604 aa  97.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.17 
 
 
526 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  28.26 
 
 
547 aa  95.1  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  23.41 
 
 
533 aa  93.6  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  25.96 
 
 
467 aa  92.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  22.42 
 
 
569 aa  92.8  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  24.89 
 
 
549 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.87 
 
 
522 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  24.59 
 
 
568 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.22 
 
 
520 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.05 
 
 
561 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  25.96 
 
 
568 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  26.49 
 
 
562 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  25.95 
 
 
581 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  27.45 
 
 
566 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  24 
 
 
590 aa  88.6  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.19 
 
 
492 aa  88.2  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  22.84 
 
 
590 aa  87.4  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  24.72 
 
 
517 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  23.93 
 
 
596 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  22.45 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  23.02 
 
 
598 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  22.83 
 
 
501 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  22.81 
 
 
502 aa  84.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  23.64 
 
 
545 aa  84.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  27.96 
 
 
473 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  23.7 
 
 
562 aa  83.2  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.81 
 
 
492 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.32 
 
 
483 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.52 
 
 
522 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.08 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  27.8 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  22.7 
 
 
597 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.03 
 
 
492 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.03 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.56 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.03 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.03 
 
 
492 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.03 
 
 
492 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.66 
 
 
613 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  24.92 
 
 
509 aa  80.9  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.86 
 
 
550 aa  80.9  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.81 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  25.6 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  26.09 
 
 
566 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  22.52 
 
 
488 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.08 
 
 
474 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  22.07 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>