37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1225 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  98.7 
 
 
384 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  99.74 
 
 
386 aa  789    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  98.95 
 
 
380 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  100 
 
 
386 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  45.38 
 
 
392 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  45.12 
 
 
392 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  44.85 
 
 
392 aa  330  4e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  40.91 
 
 
368 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  40.91 
 
 
368 aa  299  7e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  40.91 
 
 
368 aa  299  7e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  40.91 
 
 
368 aa  299  7e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  40.37 
 
 
368 aa  296  6e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  40.64 
 
 
368 aa  296  6e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  40.37 
 
 
368 aa  296  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1372  N-acetylneuraminic acid mutarotase  35.5 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0355  N-acetylneuraminic acid mutarotase  34.66 
 
 
388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1371  hypothetical protein  29.14 
 
 
356 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0722  putative lipoprotein  32.46 
 
 
384 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  32.46 
 
 
383 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  26.67 
 
 
883 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  28.46 
 
 
418 aa  90.5  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  28.7 
 
 
383 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  38.84 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1051  hypothetical protein  31.02 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  25.51 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  25.37 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  38.89 
 
 
356 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3891  hypothetical protein  33.77 
 
 
92 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  33.33 
 
 
1474 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 
850 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0451  kelch repeat-containing protein  20.48 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  28.85 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  28.15 
 
 
368 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  26.06 
 
 
990 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  23.42 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  22.36 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  22.45 
 
 
280 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.999489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>