36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3255 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 383 aa  792    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  44.47 
 
 		 883 aa  312  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  28.85 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  29.09 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  26.79 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0722  putative lipoprotein  27.03 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.69 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 850 aa  92.4  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  24.1 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.26 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  23.03 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  25.71 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.26 
 
 		 386 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.26 
 
 		 386 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  25.14 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.94 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.94 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.52 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0355  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.47 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1372  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.05 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  22.81 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  22.81 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  22.81 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  22.81 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  22.81 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  22.81 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1371  hypothetical protein  21.89 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  23.71 
 
 		 368 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 461 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  26.49 
 
 		 557 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  21.37 
 
 		 993 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  25.66 
 
 		 318 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1514 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.22 
 
 		 1451 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  29.66 
 
 		 1656 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  29.41 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>