33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1514 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 384 aa  785    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  33.06 
 
 		 383 aa  209  6e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0722  putative lipoprotein  29.68 
 
 		 384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1051  hypothetical protein  22.78 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  25.95 
 
 		 883 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  24.86 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  27.46 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.79 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.79 
 
 		 392 aa  89.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.36 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  21.3 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  23.8 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  25.71 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  22.59 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.61 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.18 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.18 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  26.18 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.14 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  26.18 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  26.18 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.18 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  23.65 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.37 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.37 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1371  hypothetical protein  24.58 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 850 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0355  N-acetylneuraminic acid mutarotase  23.18 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  25.59 
 
 		 667 aa  53.5  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  22.92 
 
 		 639 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1372  N-acetylneuraminic acid mutarotase  22.92 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  23.16 
 
 		 1474 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1557 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>