57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0169 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 483 aa  904    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  62.07 
 
 		 514 aa  292  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  31.27 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  30.06 
 
 		 776 aa  97.8  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  31.67 
 
 		 341 aa  92.8  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1557 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  29.79 
 
 		 586 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  29.24 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  28.33 
 
 		 795 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  32.72 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  26.83 
 
 		 344 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  33.81 
 
 		 646 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  32.73 
 
 		 1762 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  31.01 
 
 		 990 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  29.88 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  32.35 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  29.03 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  31.93 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  34.46 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 471 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  33.72 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.08 
 
 		 1453 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  26.2 
 
 		 321 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  26.1 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  30.39 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  27.97 
 
 		 2942 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  29.48 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  34.01 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  25.1 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  31.39 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 1009 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  35.09 
 
 		 1009 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  24.71 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  35.09 
 
 		 1017 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  26.56 
 
 		 605 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  27.82 
 
 		 993 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  31.89 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  25.33 
 
 		 833 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  23.97 
 
 		 1656 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  22.52 
 
 		 1461 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  23.16 
 
 		 326 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  28.69 
 
 		 1407 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  24.9 
 
 		 377 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  23.28 
 
 		 366 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.92 
 
 		 1451 aa  53.9  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.69 
 
 		 2449 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  25.7 
 
 		 717 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  27.01 
 
 		 179 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  25.83 
 
 		 1245 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  36.84 
 
 		 1514 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  37.18 
 
 		 812 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  29.55 
 
 		 382 aa  47.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  21.4 
 
 		 280 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  28.4 
 
 		 693 aa  47  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  31.15 
 
 		 698 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>