38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2528 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  39.04 
 
 		 605 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  36.87 
 
 		 366 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  37.65 
 
 		 586 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  42.14 
 
 		 646 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  38.33 
 
 		 642 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  34.64 
 
 		 377 aa  88.2  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  38.46 
 
 		 1744 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  35.98 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  36.93 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  37.01 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  36.05 
 
 		 448 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  33.13 
 
 		 833 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  39.86 
 
 		 1245 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  33.1 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1762 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  28.87 
 
 		 318 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  30.54 
 
 		 312 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  26.88 
 
 		 471 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  26.25 
 
 		 339 aa  52  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  25.56 
 
 		 483 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  28.14 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  27.42 
 
 		 795 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  29.14 
 
 		 317 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  24.14 
 
 		 445 aa  45.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80234  carboxymethyltransferase  31.39 
 
 		 692 aa  45.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  33.08 
 
 		 831 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 461 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  26.32 
 
 		 494 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.78 
 
 		 693 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  22.78 
 
 		 341 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  28.14 
 
 		 321 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  25.15 
 
 		 339 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 454 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2488  hypothetical protein  43.08 
 
 		 433 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24976  predicted protein  26.7 
 
 		 936 aa  41.6  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  23.9 
 
 		 1557 aa  41.2  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  27.27 
 
 		 373 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>