100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2642 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  100 
 
 
366 aa  749    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  40.59 
 
 
377 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  36.5 
 
 
382 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  38.68 
 
 
605 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  38.34 
 
 
642 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  40.91 
 
 
450 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  42.05 
 
 
484 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  41.33 
 
 
448 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  35.44 
 
 
586 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  38.43 
 
 
646 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  33.81 
 
 
833 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  33.24 
 
 
1245 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  30.18 
 
 
1744 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  29.75 
 
 
312 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  36.87 
 
 
179 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  24.76 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  29.02 
 
 
1762 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  27.47 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  23.21 
 
 
776 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1457  kelch repeat-containing protein  30.91 
 
 
487 aa  76.3  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  28.84 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  29.22 
 
 
1017 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  27.9 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  33.71 
 
 
154 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 
1009 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  29.22 
 
 
1009 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  24.36 
 
 
1557 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  25.57 
 
 
797 aa  66.6  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  29.17 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  24.35 
 
 
1222 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  23.4 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  27.84 
 
 
373 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  25.7 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  24.53 
 
 
593 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  25.1 
 
 
795 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  35.62 
 
 
638 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  27.5 
 
 
781 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  27.19 
 
 
781 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  25.93 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 
508 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03800  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  26.21 
 
 
465 aa  56.6  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  24.15 
 
 
517 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
454 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  22.64 
 
 
2942 aa  56.2  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  20.39 
 
 
488 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  25 
 
 
471 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  26.46 
 
 
430 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  27.07 
 
 
993 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  28.46 
 
 
693 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  24.55 
 
 
947 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  25.4 
 
 
652 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  24.55 
 
 
909 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  27.42 
 
 
671 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  25.4 
 
 
652 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  23.53 
 
 
334 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  31.21 
 
 
236 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  26.47 
 
 
717 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.46 
 
 
1453 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  23.21 
 
 
1656 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  28.99 
 
 
1567 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  25.61 
 
 
806 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  25.61 
 
 
806 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  25.61 
 
 
806 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  25.61 
 
 
806 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  26.87 
 
 
812 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  25.61 
 
 
806 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  25.61 
 
 
806 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  22.61 
 
 
1461 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  25.61 
 
 
806 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  26.46 
 
 
806 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  22.71 
 
 
910 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  23.33 
 
 
990 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  30.97 
 
 
698 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  22.73 
 
 
667 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  24.82 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2524  hypothetical protein  24.32 
 
 
667 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  23.28 
 
 
483 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  25.61 
 
 
858 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  25.61 
 
 
805 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  25.61 
 
 
800 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  27.48 
 
 
831 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  25.61 
 
 
800 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  24.85 
 
 
1000 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  25.26 
 
 
807 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  37.65 
 
 
757 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27916  predicted protein  27.55 
 
 
577 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  23.69 
 
 
1100 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  25.26 
 
 
858 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  25.26 
 
 
858 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2488  hypothetical protein  27.98 
 
 
433 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  28.47 
 
 
918 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  27.78 
 
 
514 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00813  conserved kelch repeat protein TeaB (Eurofung)  31.43 
 
 
713 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.17 
 
 
1451 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  23.5 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  24.52 
 
 
759 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  23.67 
 
 
1407 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  31 
 
 
180 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4720  hypothetical protein  29.29 
 
 
473 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.566617 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80234  carboxymethyltransferase  26.61 
 
 
692 aa  43.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.363907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>