135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49706 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  85.43 
 
 		 1567 aa  1371    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  100 
 
 		 1222 aa  2514    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  47.73 
 
 		 638 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  45.81 
 
 		 807 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  46 
 
 		 805 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  46 
 
 		 858 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  46 
 
 		 800 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  46 
 
 		 858 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  46 
 
 		 858 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  46 
 
 		 800 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  35.52 
 
 		 806 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  44.06 
 
 		 806 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  44.06 
 
 		 806 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  44.06 
 
 		 806 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  44.06 
 
 		 806 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  44.06 
 
 		 806 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  44.06 
 
 		 806 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  44.06 
 
 		 806 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  42.8 
 
 		 1100 aa  357  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  41.46 
 
 		 1000 aa  342  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  31.15 
 
 		 918 aa  227  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  33.33 
 
 		 593 aa  201  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  29.98 
 
 		 781 aa  145  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  29.78 
 
 		 781 aa  145  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  29.23 
 
 		 831 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  27.27 
 
 		 759 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  27.97 
 
 		 797 aa  130  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  26.58 
 
 		 909 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  26.58 
 
 		 947 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  24.85 
 
 		 517 aa  104  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  31.13 
 
 		 757 aa  91.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  35.48 
 
 		 436 aa  88.6  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  26.07 
 
 		 671 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  22.61 
 
 		 652 aa  78.2  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  22.61 
 
 		 652 aa  78.2  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.22 
 
 		 476 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  32.26 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  35.88 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  33.33 
 
 		 482 aa  73.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  31.25 
 
 		 672 aa  72.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  32.85 
 
 		 495 aa  72  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  22.22 
 
 		 650 aa  71.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  29.07 
 
 		 794 aa  69.3  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  34.92 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  38.17 
 
 		 726 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  39.76 
 
 		 1016 aa  65.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  24.35 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  24.3 
 
 		 1245 aa  65.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  34.92 
 
 		 411 aa  64.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  27.98 
 
 		 789 aa  64.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  28.77 
 
 		 884 aa  64.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  28.07 
 
 		 487 aa  63.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  25.99 
 
 		 646 aa  63.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  29.57 
 
 		 957 aa  62.4  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  25.07 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.58 
 
 		 466 aa  62  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  36.72 
 
 		 1148 aa  61.6  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  24.81 
 
 		 412 aa  61.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  38.89 
 
 		 618 aa  61.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  26.67 
 
 		 1187 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  30.96 
 
 		 1139 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  33.88 
 
 		 1577 aa  60.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.35 
 
 		 507 aa  60.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  23.57 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  28.05 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  26.95 
 
 		 1259 aa  58.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.26 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  33.07 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.86 
 
 		 472 aa  57.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  28.99 
 
 		 691 aa  58.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.79 
 
 		 507 aa  58.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.95 
 
 		 474 aa  57.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.99 
 
 		 514 aa  57.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  31.5 
 
 		 448 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  29.37 
 
 		 474 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  28.35 
 
 		 963 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  38.36 
 
 		 468 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  27.69 
 
 		 560 aa  56.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  29.29 
 
 		 493 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  30 
 
 		 771 aa  56.2  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.03 
 
 		 507 aa  55.5  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  24.66 
 
 		 373 aa  55.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  32.56 
 
 		 644 aa  54.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  27.34 
 
 		 491 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  28.91 
 
 		 430 aa  53.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  29.69 
 
 		 571 aa  53.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  32.06 
 
 		 430 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  27.7 
 
 		 382 aa  52.4  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  35.63 
 
 		 2170 aa  52.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  29.2 
 
 		 1461 aa  52.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  29.55 
 
 		 558 aa  52.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  28 
 
 		 503 aa  51.6  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  31.78 
 
 		 1049 aa  52  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  27.56 
 
 		 563 aa  51.6  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  31.76 
 
 		 824 aa  51.6  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  32.95 
 
 		 586 aa  51.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.16 
 
 		 493 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  31.82 
 
 		 605 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  34.68 
 
 		 423 aa  50.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>