152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4177 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  100 
 
 		 430 aa  861    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  49.88 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  57.2 
 
 		 365 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  59.62 
 
 		 259 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  49.22 
 
 		 266 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  41.62 
 
 		 430 aa  247  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  37.59 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  46.33 
 
 		 260 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  61.74 
 
 		 576 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  46.23 
 
 		 254 aa  173  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  46.7 
 
 		 264 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  56.46 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  40.5 
 
 		 244 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  38.65 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0608  hypothetical protein  39.81 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  29.58 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  42.48 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  41.21 
 
 		 233 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  38.51 
 
 		 489 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1273  Pectate lyase  35.47 
 
 		 346 aa  97.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3322  Pectate lyase  36.06 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2020  Pectate lyase  38.81 
 
 		 574 aa  94.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0988  Pectate lyase  36.84 
 
 		 351 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  40.3 
 
 		 511 aa  84  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.32 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  37.2 
 
 		 794 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1373  type III helper protein HrpW1  37.4 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000104079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  34.34 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  38.52 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  36.57 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  33.33 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  33.76 
 
 		 806 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  33.76 
 
 		 806 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  33.76 
 
 		 806 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.76 
 
 		 806 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  34.13 
 
 		 1016 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  34.67 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  34.67 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  34.67 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  34.03 
 
 		 487 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  32.87 
 
 		 805 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  32.87 
 
 		 807 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  32.05 
 
 		 806 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  32.87 
 
 		 858 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  32.87 
 
 		 800 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.87 
 
 		 858 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.87 
 
 		 858 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  32.87 
 
 		 800 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  28.8 
 
 		 563 aa  63.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  32.61 
 
 		 510 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  33.57 
 
 		 503 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  33.33 
 
 		 890 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  31.97 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  30.06 
 
 		 1259 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  29.94 
 
 		 1413 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1184  type III helper protein HrpW1  32.32 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  34.92 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.65 
 
 		 933 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.37 
 
 		 1072 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  31.94 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  32.54 
 
 		 634 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.29 
 
 		 756 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  31.88 
 
 		 771 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  32.54 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  33.64 
 
 		 618 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  30.07 
 
 		 1567 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  32.93 
 
 		 737 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  38.38 
 
 		 1100 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  31.45 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  33.09 
 
 		 1207 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  34.13 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.58 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  29.73 
 
 		 1000 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  30.43 
 
 		 863 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  29.86 
 
 		 1222 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.22 
 
 		 695 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  33.82 
 
 		 576 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  31.52 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  31.45 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.43 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  26.67 
 
 		 571 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  22.11 
 
 		 672 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.65 
 
 		 507 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  34.96 
 
 		 489 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  32.37 
 
 		 516 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  28.12 
 
 		 803 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  32.09 
 
 		 748 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  30.47 
 
 		 732 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  30.64 
 
 		 384 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  34.75 
 
 		 582 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  29.17 
 
 		 537 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  30.5 
 
 		 567 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  31.45 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  32.28 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  28.68 
 
 		 801 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  28.68 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  29.41 
 
 		 644 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  29.93 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.69 
 
 		 815 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  25.79 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>