27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_06748 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  100 
 
 
257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  60.16 
 
 
260 aa  296  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  55.26 
 
 
264 aa  285  5e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  53.91 
 
 
254 aa  252  5.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  40.87 
 
 
244 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  41.15 
 
 
365 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  41.47 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  39.73 
 
 
430 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  38.97 
 
 
427 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  37.95 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  39 
 
 
445 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  39.15 
 
 
430 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2020  Pectate lyase  34.46 
 
 
574 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  35.06 
 
 
489 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0608  hypothetical protein  38.69 
 
 
452 aa  89.4  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  31.55 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  36.69 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1373  type III helper protein HrpW1  32.09 
 
 
424 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000104079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1184  type III helper protein HrpW1  31.18 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  32 
 
 
392 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3322  Pectate lyase  39.75 
 
 
347 aa  72  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1273  Pectate lyase  36.31 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0988  Pectate lyase  38.51 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  33.61 
 
 
424 aa  62.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  29.65 
 
 
380 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  30.71 
 
 
511 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0897  hypothetical protein  26.74 
 
 
361 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>