20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3322 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3322  Pectate lyase  100 
 
 		 347 aa  716    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0988  Pectate lyase  92.59 
 
 		 351 aa  668    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1273  Pectate lyase  63.07 
 
 		 346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0608  hypothetical protein  54.69 
 
 		 452 aa  360  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  58.44 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  37.87 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  39.46 
 
 		 430 aa  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  35.75 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  37.75 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  36.14 
 
 		 427 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  36.14 
 
 		 259 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  36.06 
 
 		 430 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  35.75 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  35.87 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  37.43 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  39.75 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  33.97 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  38.81 
 
 		 460 aa  59.3  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  34.41 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  31.93 
 
 		 489 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>