27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2563 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  72.77 
 
 		 266 aa  363  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  67.7 
 
 		 427 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  64.63 
 
 		 430 aa  316  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  59.5 
 
 		 365 aa  309  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  57.2 
 
 		 445 aa  279  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  59.62 
 
 		 430 aa  258  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  47.1 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  48.43 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  47.37 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  40.8 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  41.47 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  46.15 
 
 		 460 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0608  hypothetical protein  40.29 
 
 		 452 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  42.08 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  43.5 
 
 		 489 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2020  Pectate lyase  38.2 
 
 		 574 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  41.33 
 
 		 511 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.55 
 
 		 424 aa  99.8  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3322  Pectate lyase  36.14 
 
 		 347 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1273  Pectate lyase  36.82 
 
 		 346 aa  96.3  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  36.14 
 
 		 392 aa  95.9  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0988  Pectate lyase  35.64 
 
 		 351 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1373  type III helper protein HrpW1  37.11 
 
 		 424 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000104079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1184  type III helper protein HrpW1  39.1 
 
 		 441 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  32.96 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0897  hypothetical protein  29.91 
 
 		 361 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>