22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1184 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1184  type III helper protein HrpW1  100 
 
 		 441 aa  870    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1373  type III helper protein HrpW1  84.19 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000104079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  50 
 
 		 489 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2020  Pectate lyase  54.91 
 
 		 574 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  36.73 
 
 		 233 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  41.21 
 
 		 511 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  40 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  40.11 
 
 		 424 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  40.34 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  38.93 
 
 		 427 aa  89.7  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  39.1 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  38.21 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  38.13 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  39.23 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0897  hypothetical protein  32.44 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  35.25 
 
 		 266 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  34.56 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  32.58 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  37.23 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  31.51 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  29.55 
 
 		 264 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  33.09 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>