26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_02542 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  100 
 
 		 264 aa  543  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  73.48 
 
 		 260 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  62.26 
 
 		 254 aa  317  9e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  60.34 
 
 		 257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  44.64 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  48.37 
 
 		 427 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  43.5 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  47.37 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  46.36 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  41.67 
 
 		 445 aa  172  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  43.44 
 
 		 430 aa  170  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  48.95 
 
 		 430 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0608  hypothetical protein  39.81 
 
 		 452 aa  111  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  35.38 
 
 		 392 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  40.94 
 
 		 460 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1273  Pectate lyase  37.37 
 
 		 346 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  36.08 
 
 		 489 aa  85.5  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  39.85 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2020  Pectate lyase  31.21 
 
 		 574 aa  82  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0988  Pectate lyase  32.91 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3322  Pectate lyase  35.75 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1373  type III helper protein HrpW1  29.44 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000104079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  30.46 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1184  type III helper protein HrpW1  29.86 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  32.5 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  27.5 
 
 		 380 aa  52  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.396388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>