65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1854 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  100 
 
 		 460 aa  929    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  100 
 
 		 653 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  50 
 
 		 233 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  37.55 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  47.44 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2020  Pectate lyase  42.11 
 
 		 574 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  44.79 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  46.01 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1373  type III helper protein HrpW1  39.71 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000104079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  46.15 
 
 		 259 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1184  type III helper protein HrpW1  39.8 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  36.33 
 
 		 365 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  42.14 
 
 		 430 aa  119  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  41.82 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  42.48 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  34.55 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  40 
 
 		 264 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  36.6 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.396388 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  38.61 
 
 		 260 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  36.9 
 
 		 254 aa  96.7  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  39.75 
 
 		 667 aa  91.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  36.81 
 
 		 257 aa  86.7  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0897  hypothetical protein  29.15 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  36.42 
 
 		 244 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.93 
 
 		 3197 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0608  hypothetical protein  42.76 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1273  Pectate lyase  37.95 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.35 
 
 		 3197 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  40.87 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  26.7 
 
 		 1260 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0988  Pectate lyase  34.12 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3322  Pectate lyase  33.91 
 
 		 347 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  25 
 
 		 1655 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  29 
 
 		 2105 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1839  hypothetical protein  25.36 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2623  hypothetical protein  25.29 
 
 		 216 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  48.28 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  26 
 
 		 824 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.32 
 
 		 855 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  28.37 
 
 		 1281 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2504  hypothetical protein  27.37 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  40.62 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2499  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.46 
 
 		 703 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1097  hypothetical protein  27.35 
 
 		 696 aa  50.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1636  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.67 
 
 		 627 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.41391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  71.43 
 
 		 329 aa  50.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  48.39 
 
 		 771 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  28.93 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2598  hypothetical protein  27.6 
 
 		 225 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.243823  hitchhiker  0.00133027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  41.11 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1374  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1362 aa  47.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  50 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  38.03 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  45.45 
 
 		 916 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2387  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.38 
 
 		 515 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  23.03 
 
 		 838 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  39.08 
 
 		 359 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  59.52 
 
 		 1034 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  48.15 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.18 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2643  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2241  hypothetical protein  25.62 
 
 		 695 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 628 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 293 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  41.67 
 
 		 671 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>