15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0897 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0897  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  721    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  47.84 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  36.32 
 
 		 489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2020  Pectate lyase  34.01 
 
 		 574 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  29.15 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  29.51 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1184  type III helper protein HrpW1  32.44 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  27.98 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1373  type III helper protein HrpW1  30.81 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000104079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  27.12 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  39.13 
 
 		 427 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  26.74 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  28.22 
 
 		 244 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  32.2 
 
 		 430 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  22.14 
 
 		 266 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>