27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3987 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2501  hypothetical protein  43.92 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2522  hypothetical protein  41.03 
 
 		 189 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4737  hypothetical protein  43.75 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1892  hypothetical protein  37.58 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.957451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2227  hypothetical protein  31.84 
 
 		 249 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2675  hypothetical protein  40.44 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.912699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  36.72 
 
 		 1062 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  36.59 
 
 		 3197 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  37.25 
 
 		 3197 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1680  hypothetical protein  29.23 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2625  hypothetical protein  28.24 
 
 		 2311 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2241  hypothetical protein  29.29 
 
 		 695 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  28.93 
 
 		 460 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  27.85 
 
 		 653 aa  48.5  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.93 
 
 		 1037 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1616  hypothetical protein  26.88 
 
 		 478 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0937959  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.05 
 
 		 824 aa  45.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1374  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1362 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3422  FHA domain-containing protein  25.81 
 
 		 462 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0854  hypothetical protein  26.09 
 
 		 419 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0320102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2504  hypothetical protein  26.87 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1839  hypothetical protein  28.36 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2598  hypothetical protein  36.73 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.243823  hitchhiker  0.00133027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4280  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000396864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3523  hypothetical protein  28.43 
 
 		 294 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2623  hypothetical protein  27.27 
 
 		 216 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>