29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0608 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0608  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  891    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3322  Pectate lyase  55 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0988  Pectate lyase  56.07 
 
 		 351 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1273  Pectate lyase  55.79 
 
 		 346 aa  362  9e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  71.43 
 
 		 392 aa  355  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  50.88 
 
 		 424 aa  232  9e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  61.57 
 
 		 733 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  43.66 
 
 		 430 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  41.82 
 
 		 445 aa  137  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  39.39 
 
 		 365 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  37.6 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  39.6 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  39.81 
 
 		 430 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  40.29 
 
 		 259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  35.92 
 
 		 264 aa  119  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  41.28 
 
 		 254 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  37.04 
 
 		 260 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  39.16 
 
 		 257 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  37.82 
 
 		 244 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  42.76 
 
 		 460 aa  83.2  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  37.58 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  40.22 
 
 		 1316 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  34.19 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  49.23 
 
 		 769 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  32.5 
 
 		 511 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3428  hypothetical protein  31.43 
 
 		 720 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660009  hitchhiker  0.0000342661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  37.33 
 
 		 1107 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  30.95 
 
 		 1199 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  32.68 
 
 		 380 aa  43.1  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.396388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>