13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3428 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3428  hypothetical protein  100 
 
 		 720 aa  1496    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660009  hitchhiker  0.0000342661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0704  16S rRNA dimethylase  55.15 
 
 		 675 aa  181  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2872  hypothetical protein  50.51 
 
 		 877 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.44334  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3918  hypothetical protein  54.12 
 
 		 409 aa  99  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135148  normal  0.570167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3238  hypothetical protein  46.94 
 
 		 652 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359216  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  50 
 
 		 638 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  56.25 
 
 		 550 aa  71.6  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2985  hypothetical protein  37.25 
 
 		 667 aa  67.4  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000400495  hitchhiker  0.00618409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  39.74 
 
 		 897 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  34.65 
 
 		 818 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  35.42 
 
 		 763 aa  47.4  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0953  hypothetical protein  25.75 
 
 		 471 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  34.62 
 
 		 128 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>