19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3918 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3918  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  842    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135148  normal  0.570167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3428  hypothetical protein  48.6 
 
 		 720 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660009  hitchhiker  0.0000342661 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2148  polysaccharide lyase polysaccharide lyase family 14 protein  31.35 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6673  hypothetical protein  31.48 
 
 		 296 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0268195  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  57.83 
 
 		 638 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3238  hypothetical protein  53.01 
 
 		 652 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359216  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2872  hypothetical protein  47.56 
 
 		 877 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.44334  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0704  16S rRNA dimethylase  44.44 
 
 		 675 aa  79.7  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1714  hypothetical protein  28.32 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.0527945 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01760  expressed protein  30.8 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.341755  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01710  hypothetical protein  30.23 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2985  hypothetical protein  38.83 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000400495  hitchhiker  0.00618409 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5472  hypothetical protein  27.09 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.799935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7279  hypothetical protein  28.11 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0333  hypothetical protein  30.34 
 
 		 292 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  normal  0.839934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2484  hypothetical protein  24.42 
 
 		 271 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305299  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0679  hypothetical protein  21.78 
 
 		 504 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  30.63 
 
 		 827 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  25.85 
 
 		 694 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>