21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2148 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2148  polysaccharide lyase polysaccharide lyase family 14 protein  100 
 
 		 356 aa  737    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5472  hypothetical protein  43.63 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.799935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6673  hypothetical protein  35.78 
 
 		 296 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0268195  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3918  hypothetical protein  36.36 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135148  normal  0.570167 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01710  hypothetical protein  32.38 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1714  hypothetical protein  30.17 
 
 		 339 aa  99.4  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.0527945 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01760  expressed protein  30.65 
 
 		 497 aa  96.3  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.341755  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2484  hypothetical protein  28.74 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305299  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0679  hypothetical protein  32.02 
 
 		 504 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  40.45 
 
 		 1108 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0333  hypothetical protein  32.44 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  normal  0.839934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  37.8 
 
 		 815 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7279  hypothetical protein  26.37 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3186  hypothetical protein  31.48 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0268  hypothetical protein  36.47 
 
 		 604 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  30.97 
 
 		 763 aa  46.2  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  35.14 
 
 		 541 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  30.95 
 
 		 978 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  34.29 
 
 		 1441 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2854  hypothetical protein  29.33 
 
 		 911 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.504296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0427  mannosidase-related protein  32.53 
 
 		 2443 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.37928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>