14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5472 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5472  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  693    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.799935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2148  polysaccharide lyase polysaccharide lyase family 14 protein  42.86 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6673  hypothetical protein  30.94 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0268195  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3918  hypothetical protein  28.69 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135148  normal  0.570167 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01710  hypothetical protein  30.08 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01760  expressed protein  26.79 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.341755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0333  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  normal  0.839934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1714  hypothetical protein  31.5 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.0527945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2484  hypothetical protein  27.45 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305299  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2502  hypothetical protein  29.83 
 
 		 410 aa  52.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2114  hypothetical protein  28.66 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3186  hypothetical protein  28.41 
 
 		 262 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2498  hypothetical protein  38.16 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0391  hypothetical protein  29.59 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>