11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2484 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2484  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  552  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305299  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1714  hypothetical protein  31 
 
 		 339 aa  79  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.0527945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6673  hypothetical protein  31.07 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0268195  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2148  polysaccharide lyase polysaccharide lyase family 14 protein  27.17 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0333  hypothetical protein  23.48 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  normal  0.839934 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01760  expressed protein  28.02 
 
 		 497 aa  58.9  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.341755  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3918  hypothetical protein  24.63 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135148  normal  0.570167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0679  hypothetical protein  29.32 
 
 		 504 aa  49.3  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01710  hypothetical protein  23.65 
 
 		 401 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5472  hypothetical protein  26.14 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.799935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3186  hypothetical protein  28.26 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>