23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0679 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0679  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1034    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6673  hypothetical protein  29.89 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0268195  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2499  hypothetical protein  31.25 
 
 		 698 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2148  polysaccharide lyase polysaccharide lyase family 14 protein  27.84 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7279  hypothetical protein  32.32 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2502  hypothetical protein  29.25 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1947  hypothetical protein  26.85 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  26.02 
 
 		 1219 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2331  hypothetical protein  34.09 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000168007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  24.64 
 
 		 696 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1124  hypothetical protein  32.98 
 
 		 868 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0137  hypothetical protein  34.52 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0482876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1107  hypothetical protein  29.35 
 
 		 695 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3918  hypothetical protein  21.78 
 
 		 409 aa  50.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135148  normal  0.570167 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2114  hypothetical protein  25.98 
 
 		 373 aa  50.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2498  hypothetical protein  32.38 
 
 		 307 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1714  hypothetical protein  30 
 
 		 339 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.0527945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2484  hypothetical protein  29.32 
 
 		 271 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305299  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  35.71 
 
 		 1096 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1130  hypothetical protein  35.44 
 
 		 285 aa  47.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4604  hypothetical protein  30.07 
 
 		 174 aa  47  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0391  hypothetical protein  28.31 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  26.76 
 
 		 827 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>