46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09473 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  100 
 
 		 1441 aa  2851    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  48.48 
 
 		 1031 aa  264  8e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  30.77 
 
 		 528 aa  106  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  35.51 
 
 		 1345 aa  70.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1070 aa  59.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1024 aa  59.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  28.67 
 
 		 1063 aa  58.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2854  hypothetical protein  37.14 
 
 		 911 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.504296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09933  hypothetical protein  32.95 
 
 		 349 aa  57  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  37.33 
 
 		 924 aa  54.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  33.67 
 
 		 957 aa  54.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 541 aa  53.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  32.88 
 
 		 483 aa  54.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1093 aa  53.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  35.14 
 
 		 1141 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2389  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.46 
 
 		 533 aa  52.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.377717  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  32.33 
 
 		 669 aa  52.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  37.76 
 
 		 827 aa  52.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  36.11 
 
 		 655 aa  52  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  30.88 
 
 		 416 aa  52  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  34.52 
 
 		 461 aa  51.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  35.71 
 
 		 657 aa  51.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  32.93 
 
 		 1083 aa  50.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  30.19 
 
 		 243 aa  50.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  38.57 
 
 		 613 aa  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12818  hypothetical protein  31.96 
 
 		 192 aa  50.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.562782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  29.73 
 
 		 356 aa  49.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  34.83 
 
 		 654 aa  49.3  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  32.26 
 
 		 469 aa  48.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0427  mannosidase-related protein  24.57 
 
 		 2443 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.37928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  36 
 
 		 929 aa  48.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  28.57 
 
 		 2239 aa  48.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  34.67 
 
 		 1154 aa  47.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  25.21 
 
 		 480 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  34.25 
 
 		 1118 aa  47.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  32.43 
 
 		 2364 aa  47.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0922  hypothetical protein  35.14 
 
 		 730 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0622402  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  38.46 
 
 		 1302 aa  47  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  26.07 
 
 		 762 aa  47  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  29.79 
 
 		 1132 aa  47  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  32.43 
 
 		 1108 aa  46.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0626  hypothetical protein  26.26 
 
 		 288 aa  46.6  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  38.03 
 
 		 755 aa  45.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  33.77 
 
 		 491 aa  45.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  29.55 
 
 		 927 aa  45.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.77 
 
 		 1679 aa  45.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>