27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0715 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  50 
 
 		 460 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  42.71 
 
 		 489 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2020  Pectate lyase  39.09 
 
 		 574 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  45.51 
 
 		 511 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  42.86 
 
 		 424 aa  131  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1373  type III helper protein HrpW1  39.8 
 
 		 424 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000104079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  46.98 
 
 		 427 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1184  type III helper protein HrpW1  36.73 
 
 		 441 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  50.39 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  43.9 
 
 		 365 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  42.76 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  36.45 
 
 		 430 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  42.18 
 
 		 430 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  37.32 
 
 		 380 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  44.96 
 
 		 445 aa  99.4  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  41.5 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  39.85 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  33.84 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  31.55 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0897  hypothetical protein  29.51 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  35.26 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0608  hypothetical protein  37.58 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0988  Pectate lyase  38.3 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1273  Pectate lyase  42.34 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3322  Pectate lyase  34.41 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  35.61 
 
 		 392 aa  48.9  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>