25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2020 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2020  Pectate lyase  100 
 
 		 574 aa  1058    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  76.37 
 
 		 489 aa  361  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1184  type III helper protein HrpW1  38.57 
 
 		 441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2021  type III effector protein  54.12 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1373  type III helper protein HrpW1  42.36 
 
 		 424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000104079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  39.09 
 
 		 233 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  42.86 
 
 		 511 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  38.54 
 
 		 460 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.52 
 
 		 424 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0897  hypothetical protein  33.88 
 
 		 361 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  43.8 
 
 		 365 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  42.45 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  40.71 
 
 		 259 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  41.61 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  38.25 
 
 		 380 aa  99.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  39.39 
 
 		 266 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  34.21 
 
 		 257 aa  91.3  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  35.16 
 
 		 260 aa  90.9  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  38.81 
 
 		 430 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  39.86 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  33.14 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  28.57 
 
 		 264 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  28.57 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  37 
 
 		 839 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1198 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>