51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1210 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  98.98 
 
 		 781 aa  1551    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  100 
 
 		 781 aa  1565    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  43.55 
 
 		 831 aa  620  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  35.46 
 
 		 797 aa  258  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  33.46 
 
 		 759 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  30.05 
 
 		 593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  30.43 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  28.41 
 
 		 909 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  28.41 
 
 		 947 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.94 
 
 		 858 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  31.94 
 
 		 800 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  31.94 
 
 		 805 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.94 
 
 		 858 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  31.94 
 
 		 800 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  31.94 
 
 		 858 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  32.01 
 
 		 807 aa  157  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  31.37 
 
 		 1000 aa  151  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  29.98 
 
 		 806 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  30.23 
 
 		 806 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  30.04 
 
 		 806 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  30.04 
 
 		 806 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.04 
 
 		 806 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.04 
 
 		 806 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  30.04 
 
 		 806 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  30.04 
 
 		 806 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  30.34 
 
 		 1567 aa  148  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  29.78 
 
 		 1222 aa  146  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  30.29 
 
 		 638 aa  145  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  31.12 
 
 		 1100 aa  138  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  25.39 
 
 		 517 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  26.04 
 
 		 671 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  24.22 
 
 		 650 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  26.57 
 
 		 652 aa  74.3  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  26.57 
 
 		 652 aa  74.3  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05040  glyoxal oxidase precursor, putative  25.12 
 
 		 676 aa  69.7  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.121305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  26.89 
 
 		 757 aa  66.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  27.67 
 
 		 377 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1877  Beta-propeller repeat TECPR  27.38 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03960  glyoxal oxidase precursor, putative  23.08 
 
 		 664 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.270236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  29.73 
 
 		 450 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  27.5 
 
 		 366 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  29.91 
 
 		 484 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02420  glyoxal oxidase precursor, putative  25.1 
 
 		 631 aa  55.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  30.21 
 
 		 448 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  37.93 
 
 		 382 aa  52  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  26.7 
 
 		 646 aa  51.6  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  26.65 
 
 		 1245 aa  50.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  25.65 
 
 		 833 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  25.25 
 
 		 586 aa  48.9  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  35.65 
 
 		 605 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>