51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1426 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  100 
 
 
593 aa  1210    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  36.08 
 
 
918 aa  287  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  32.42 
 
 
797 aa  220  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  31.35 
 
 
759 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  34.26 
 
 
806 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  31.57 
 
 
638 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  33.33 
 
 
1222 aa  201  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33 
 
 
806 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  33 
 
 
806 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  33 
 
 
806 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33 
 
 
806 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  33 
 
 
806 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  33 
 
 
806 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  33 
 
 
806 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  30.05 
 
 
781 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  34.71 
 
 
1100 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  30.05 
 
 
781 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  30.63 
 
 
909 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  30.63 
 
 
947 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  31.79 
 
 
1567 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.88 
 
 
858 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  32.68 
 
 
807 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.88 
 
 
858 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  32.68 
 
 
805 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  32.68 
 
 
858 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  32.68 
 
 
800 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  32.68 
 
 
800 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  32.68 
 
 
1000 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  33.72 
 
 
831 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  28.57 
 
 
517 aa  160  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  25.08 
 
 
652 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  25.08 
 
 
652 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  25.12 
 
 
650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  28.44 
 
 
671 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02420  glyoxal oxidase precursor, putative  24.29 
 
 
631 aa  92.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  27.57 
 
 
757 aa  87.4  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05040  glyoxal oxidase precursor, putative  25.67 
 
 
676 aa  83.2  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.121305  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  26.58 
 
 
450 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  27.91 
 
 
448 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  25.75 
 
 
646 aa  61.6  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  24.53 
 
 
366 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  27.6 
 
 
484 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  25.88 
 
 
377 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  31.48 
 
 
605 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  32.06 
 
 
586 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  31.3 
 
 
642 aa  54.3  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  26.67 
 
 
833 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  33.65 
 
 
1245 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03960  glyoxal oxidase precursor, putative  21.99 
 
 
664 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.270236  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  24.52 
 
 
382 aa  47.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2488  hypothetical protein  34.26 
 
 
433 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>