42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2977 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  100 
 
 
652 aa  1328    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  100 
 
 
652 aa  1328    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  70.63 
 
 
650 aa  962    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  28.44 
 
 
947 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  28.44 
 
 
909 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  25.08 
 
 
593 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  25.41 
 
 
918 aa  126  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  23.95 
 
 
517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  25.35 
 
 
671 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05040  glyoxal oxidase precursor, putative  24.61 
 
 
676 aa  84  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.121305  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02420  glyoxal oxidase precursor, putative  23.55 
 
 
631 aa  81.6  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  22.61 
 
 
1222 aa  79.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  22.82 
 
 
638 aa  76.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  26.57 
 
 
781 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  26.57 
 
 
781 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  35.59 
 
 
759 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.54 
 
 
806 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.54 
 
 
806 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  27.54 
 
 
806 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  27.54 
 
 
806 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  27.54 
 
 
806 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  27.54 
 
 
806 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  27.54 
 
 
806 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  26.32 
 
 
806 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  37.72 
 
 
1100 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03960  glyoxal oxidase precursor, putative  23.31 
 
 
664 aa  67.4  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.270236  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  34.48 
 
 
1000 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  32.79 
 
 
1567 aa  66.6  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  26.44 
 
 
797 aa  65.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.44 
 
 
858 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  36.44 
 
 
807 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  36.44 
 
 
858 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  36.44 
 
 
800 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  36.44 
 
 
800 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  36.44 
 
 
805 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.44 
 
 
858 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  27.24 
 
 
757 aa  61.2  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  25.4 
 
 
366 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  30.64 
 
 
605 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  23.87 
 
 
450 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  29.85 
 
 
377 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  26.96 
 
 
642 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>