53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2756 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  100 
 
 		 797 aa  1570    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  36.02 
 
 		 759 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  35.46 
 
 		 781 aa  258  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  35.46 
 
 		 781 aa  258  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  32.42 
 
 		 593 aa  221  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  31 
 
 		 918 aa  212  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  31.87 
 
 		 831 aa  197  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  26.98 
 
 		 909 aa  145  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  26.98 
 
 		 947 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  31.6 
 
 		 805 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  29.9 
 
 		 806 aa  142  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  31.6 
 
 		 800 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  31.6 
 
 		 858 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  31.6 
 
 		 800 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.4 
 
 		 858 aa  141  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.4 
 
 		 858 aa  141  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  29.31 
 
 		 806 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  30.47 
 
 		 638 aa  140  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.31 
 
 		 806 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  29.31 
 
 		 806 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  29.31 
 
 		 806 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.31 
 
 		 806 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  29.31 
 
 		 806 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  29.31 
 
 		 806 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  30.15 
 
 		 1100 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  31.08 
 
 		 807 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  28.66 
 
 		 517 aa  137  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  27.74 
 
 		 1222 aa  131  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  28.46 
 
 		 1567 aa  130  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  29.48 
 
 		 1000 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  31.25 
 
 		 1085 aa  98.2  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  35 
 
 		 857 aa  95.5  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  30.71 
 
 		 1091 aa  94  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  32.31 
 
 		 671 aa  90.9  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  27.96 
 
 		 650 aa  79  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  28.15 
 
 		 757 aa  72.8  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05040  glyoxal oxidase precursor, putative  26.35 
 
 		 676 aa  72  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.121305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  25.57 
 
 		 366 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  26.44 
 
 		 652 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  30.17 
 
 		 1245 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  26.44 
 
 		 652 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02420  glyoxal oxidase precursor, putative  24.37 
 
 		 631 aa  61.2  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  43.3 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1010  APHP domain protein  37.27 
 
 		 300 aa  57.4  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  25.09 
 
 		 377 aa  55.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  30.47 
 
 		 631 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  39.77 
 
 		 646 aa  51.2  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  40.78 
 
 		 605 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  29.06 
 
 		 926 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  36.84 
 
 		 642 aa  47.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  36.14 
 
 		 2030 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.49 
 
 		 6885 aa  44.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  32 
 
 		 450 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>