84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2166 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  100 
 
 		 759 aa  1545    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  36.08 
 
 		 797 aa  296  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  33.46 
 
 		 781 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  33.46 
 
 		 781 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  34.08 
 
 		 918 aa  237  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  31.35 
 
 		 593 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  30.84 
 
 		 831 aa  190  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  29.81 
 
 		 947 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  29.81 
 
 		 909 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  29.14 
 
 		 638 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  28.76 
 
 		 858 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  28.57 
 
 		 805 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  28.57 
 
 		 858 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  28.57 
 
 		 800 aa  141  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 858 aa  141  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  28.57 
 
 		 800 aa  141  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  28.65 
 
 		 807 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  27.27 
 
 		 1222 aa  137  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  26.42 
 
 		 1567 aa  136  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  35.68 
 
 		 368 aa  121  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  28.97 
 
 		 1000 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  27.34 
 
 		 806 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  27.22 
 
 		 806 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.22 
 
 		 806 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.22 
 
 		 806 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  27.22 
 
 		 806 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  27.22 
 
 		 806 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  27.22 
 
 		 806 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  27.22 
 
 		 806 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  26.59 
 
 		 517 aa  114  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  36.71 
 
 		 349 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  35.64 
 
 		 241 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  31.84 
 
 		 374 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  37.1 
 
 		 261 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  35.58 
 
 		 311 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  34.65 
 
 		 373 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  31.19 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  31.45 
 
 		 671 aa  102  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  32.68 
 
 		 401 aa  99.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  27.65 
 
 		 1100 aa  99  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.43 
 
 		 528 aa  94.7  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  32.58 
 
 		 374 aa  94  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  29.49 
 
 		 329 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  30.09 
 
 		 1282 aa  91.7  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 		 681 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  28.89 
 
 		 1234 aa  92  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  31.13 
 
 		 366 aa  90.9  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04573  conserved hypothetical protein  30.92 
 
 		 266 aa  90.5  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  27.31 
 
 		 522 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  27.78 
 
 		 828 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  29.53 
 
 		 921 aa  84  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  31.3 
 
 		 869 aa  81.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  28.77 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  28.22 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02420  glyoxal oxidase precursor, putative  23.54 
 
 		 631 aa  77  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  26.91 
 
 		 576 aa  76.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03960  glyoxal oxidase precursor, putative  22.71 
 
 		 664 aa  74.7  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.270236  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  35.59 
 
 		 652 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  35.59 
 
 		 652 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  27.15 
 
 		 749 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07158  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  26.45 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05040  glyoxal oxidase precursor, putative  23.4 
 
 		 676 aa  71.6  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.121305  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  28.7 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  27.23 
 
 		 757 aa  67.8  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  28.37 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  25.7 
 
 		 612 aa  60.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  26.37 
 
 		 688 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  27.4 
 
 		 642 aa  55.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 		 586 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  39.51 
 
 		 1245 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  31.37 
 
 		 448 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  31.37 
 
 		 450 aa  50.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  30.72 
 
 		 484 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7189  lipolytic protein G-D-S-L family  27.33 
 
 		 343 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0180  lipolytic protein G-D-S-L family  24.14 
 
 		 339 aa  47.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.743326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  24.07 
 
 		 377 aa  47.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  36.22 
 
 		 605 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  35.37 
 
 		 382 aa  46.6  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  27.37 
 
 		 189 aa  45.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  30.16 
 
 		 648 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  21.62 
 
 		 253 aa  44.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  46.03 
 
 		 646 aa  44.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  24.52 
 
 		 366 aa  44.3  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>