59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2327 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  100 
 
 		 638 aa  1272    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  55.31 
 
 		 805 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  55.31 
 
 		 800 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  55.31 
 
 		 858 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  55.31 
 
 		 858 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  55.31 
 
 		 800 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  55.31 
 
 		 858 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  55.08 
 
 		 807 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  48.14 
 
 		 1222 aa  439  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  48.98 
 
 		 806 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  47.95 
 
 		 806 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  47.75 
 
 		 806 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  47.75 
 
 		 806 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  47.75 
 
 		 806 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  47.75 
 
 		 806 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  47.75 
 
 		 806 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  47.75 
 
 		 806 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  48.55 
 
 		 1100 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  47.51 
 
 		 1000 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  47.73 
 
 		 1567 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  31.62 
 
 		 918 aa  223  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  31.53 
 
 		 593 aa  213  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  29.68 
 
 		 759 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  31.84 
 
 		 831 aa  157  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  30.65 
 
 		 781 aa  150  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  30.47 
 
 		 797 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  30.46 
 
 		 781 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  25.89 
 
 		 947 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  25.89 
 
 		 909 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  25.6 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  27.93 
 
 		 671 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  29.66 
 
 		 757 aa  88.6  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  23.32 
 
 		 652 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  23.32 
 
 		 652 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  22.26 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  28.17 
 
 		 366 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  28.69 
 
 		 646 aa  62  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  29.75 
 
 		 673 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  26.2 
 
 		 1245 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  43.59 
 
 		 1083 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  26.36 
 
 		 642 aa  53.9  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  29.85 
 
 		 450 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  27.57 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  27.91 
 
 		 448 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  44.44 
 
 		 586 aa  52  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  32.64 
 
 		 605 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  37.18 
 
 		 1126 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  40 
 
 		 1117 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  40.66 
 
 		 974 aa  50.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1762 aa  50.4  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  35.45 
 
 		 968 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  31.54 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  39.56 
 
 		 924 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  32.22 
 
 		 847 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  32.99 
 
 		 445 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2079  hypothetical protein  33.7 
 
 		 709 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  38.75 
 
 		 833 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  35.94 
 
 		 382 aa  43.9  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02420  glyoxal oxidase precursor, putative  25.19 
 
 		 631 aa  43.9  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>