21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2149 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  100 
 
 
847 aa  1707    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  38.21 
 
 
1193 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  32.26 
 
 
1514 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.56 
 
 
1535 aa  257  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  53.79 
 
 
1189 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  50.55 
 
 
1182 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  45.99 
 
 
1117 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  45.68 
 
 
673 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  44.48 
 
 
974 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  43 
 
 
968 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  47.25 
 
 
1083 aa  212  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_009092  Shew_3237  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.05 
 
 
1512 aa  204  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  40.89 
 
 
924 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  43.12 
 
 
1126 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2079  hypothetical protein  40.94 
 
 
709 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  47.22 
 
 
833 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2251  hypothetical protein  27.32 
 
 
887 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00410803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0386  hypothetical protein  58.46 
 
 
164 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3680  hypothetical protein  23.17 
 
 
549 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431002  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  32.22 
 
 
638 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.15 
 
 
3027 aa  45.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>