54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0379 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  99.67 
 
 
909 aa  1861    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  100 
 
 
947 aa  1951    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  30.63 
 
 
593 aa  196  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  27.88 
 
 
517 aa  190  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02420  glyoxal oxidase precursor, putative  29.22 
 
 
631 aa  171  9e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  29.94 
 
 
759 aa  170  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  28.76 
 
 
781 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  28.36 
 
 
781 aa  168  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  27.22 
 
 
918 aa  165  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05040  glyoxal oxidase precursor, putative  28.47 
 
 
676 aa  151  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.121305  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  26.98 
 
 
797 aa  145  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03960  glyoxal oxidase precursor, putative  25.73 
 
 
664 aa  144  9e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.270236  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  28.44 
 
 
652 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  28.44 
 
 
652 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  26.77 
 
 
650 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  26.72 
 
 
805 aa  137  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.92 
 
 
858 aa  137  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  26.72 
 
 
858 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  26.72 
 
 
800 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  26.72 
 
 
800 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.92 
 
 
858 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  27.89 
 
 
807 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  27 
 
 
671 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  27.27 
 
 
1100 aa  126  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  28 
 
 
806 aa  124  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  26.2 
 
 
1000 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.44 
 
 
806 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.44 
 
 
806 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  27.44 
 
 
806 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  27.44 
 
 
806 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  27.44 
 
 
806 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  27.44 
 
 
806 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  27.44 
 
 
806 aa  121  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  27.17 
 
 
831 aa  121  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  26.68 
 
 
1222 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  26.29 
 
 
1567 aa  110  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  25.89 
 
 
638 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  31.4 
 
 
772 aa  85.5  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5078  hypothetical protein  28.71 
 
 
809 aa  84.3  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  0.0204601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  30.3 
 
 
757 aa  78.6  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  34.69 
 
 
586 aa  55.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  23.53 
 
 
488 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  24.55 
 
 
366 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  31.08 
 
 
382 aa  53.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  22.95 
 
 
646 aa  50.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  30.67 
 
 
990 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  31.15 
 
 
1245 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  30.16 
 
 
833 aa  48.9  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  23.26 
 
 
377 aa  48.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0680  hypothetical protein  28.86 
 
 
332 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  33.02 
 
 
642 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  33.33 
 
 
339 aa  45.8  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  25.14 
 
 
448 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  24.57 
 
 
484 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>