29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2527 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 154 aa  316  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  38.69 
 
 		 586 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  37.85 
 
 		 450 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  35.21 
 
 		 605 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  33.71 
 
 		 366 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  36.26 
 
 		 646 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  30.72 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  35.04 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  35.04 
 
 		 448 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  33.1 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  30.82 
 
 		 382 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  32.31 
 
 		 642 aa  58.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  34.19 
 
 		 1245 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  36.26 
 
 		 508 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  34.74 
 
 		 833 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  29.31 
 
 		 317 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1744 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  24.66 
 
 		 445 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  29.52 
 
 		 321 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  29.52 
 
 		 321 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  34.15 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  36.99 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  24.2 
 
 		 318 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1762 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  27.38 
 
 		 993 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  23.67 
 
 		 339 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  22.54 
 
 		 1557 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  28.28 
 
 		 430 aa  41.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  34.34 
 
 		 593 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>