89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0574 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 321 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  97.2 
 
 		 321 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  86.29 
 
 		 317 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  36.21 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  37.2 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  35.81 
 
 		 344 aa  186  7e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  36.42 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  36.58 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  34.55 
 
 		 1762 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  36.81 
 
 		 373 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  31.86 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  33.45 
 
 		 776 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  33.11 
 
 		 812 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  29.59 
 
 		 795 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  31.58 
 
 		 1656 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  29.47 
 
 		 990 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  32.3 
 
 		 1557 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  31.19 
 
 		 993 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  28.33 
 
 		 445 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  30.17 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  30.12 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  29.69 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  32.39 
 
 		 1017 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 		 1009 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  32.39 
 
 		 1009 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  32.18 
 
 		 693 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  29.43 
 
 		 1461 aa  93.2  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  26.74 
 
 		 497 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  31.68 
 
 		 471 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 2942 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  29.81 
 
 		 508 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  31.17 
 
 		 586 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  29.18 
 
 		 1514 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  30.67 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  29.53 
 
 		 717 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  30.64 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  27.47 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.25 
 
 		 1453 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 461 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  32.44 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1407 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  31.44 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  32.79 
 
 		 180 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.4 
 
 		 1451 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  31.6 
 
 		 646 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  24.66 
 
 		 639 aa  66.6  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  28.33 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  29.02 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  29.67 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  42.39 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  24.32 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  30.34 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  25.59 
 
 		 667 aa  57  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  24.36 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  27.42 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  26.69 
 
 		 605 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  24.9 
 
 		 494 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  29.07 
 
 		 484 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  28.86 
 
 		 1474 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  27.74 
 
 		 376 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  29.96 
 
 		 450 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  29.07 
 
 		 448 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  31.15 
 
 		 514 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  26.29 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  26.32 
 
 		 833 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  34.13 
 
 		 1744 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  26.79 
 
 		 557 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  26.3 
 
 		 536 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  26.3 
 
 		 536 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  27.49 
 
 		 2374 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  24.62 
 
 		 335 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  23.08 
 
 		 725 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  23.05 
 
 		 383 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  26.47 
 
 		 698 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  29.61 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  28.14 
 
 		 179 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0451  kelch repeat-containing protein  23.66 
 
 		 418 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  23.24 
 
 		 460 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0984  kelch repeat-containing protein  26.24 
 
 		 358 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2941  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.05 
 
 		 1215 aa  46.2  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.972596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  24.68 
 
 		 339 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  26.2 
 
 		 372 aa  45.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42978  predicted protein  27.05 
 
 		 632 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  29.52 
 
 		 154 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  26.03 
 
 		 883 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0397  kelch repeat-containing protein  27.27 
 
 		 162 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  22.37 
 
 		 506 aa  42.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27916  predicted protein  27.04 
 
 		 577 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0545063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>