36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1841 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 339 aa  681    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  39.47 
 
 		 358 aa  226  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  41.76 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  37.03 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  29.84 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  27.05 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1762 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1557 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  27.32 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  25.48 
 
 		 812 aa  66.6  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  25.76 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  25.36 
 
 		 693 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  24.35 
 
 		 717 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  25.71 
 
 		 776 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 508 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  25.57 
 
 		 506 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  27.67 
 
 		 642 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  27.03 
 
 		 586 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  22.82 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  25.68 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  26.64 
 
 		 1656 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  28.89 
 
 		 497 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  25.21 
 
 		 321 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1514 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1407 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  27.07 
 
 		 639 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  21.5 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  26.32 
 
 		 595 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  24.52 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  23.89 
 
 		 795 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 461 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  26.67 
 
 		 406 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  25.15 
 
 		 179 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  26.06 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>