More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0145 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 454 aa  907    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  36.55 
 
 		 508 aa  272  9e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  32.62 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  29.96 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1557 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  34.08 
 
 		 312 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  31.62 
 
 		 445 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  34.36 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  36.12 
 
 		 321 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  34.65 
 
 		 776 aa  113  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  36.72 
 
 		 1762 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  35.4 
 
 		 321 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  36.99 
 
 		 314 aa  106  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  30.33 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  30.31 
 
 		 717 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  34.66 
 
 		 1407 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  32.02 
 
 		 1514 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  33.51 
 
 		 318 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  33.66 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  29.31 
 
 		 993 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  29.36 
 
 		 2942 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  28.96 
 
 		 990 aa  84  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  28.1 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  31.05 
 
 		 339 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  33.51 
 
 		 646 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  33.17 
 
 		 1009 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  33.17 
 
 		 1009 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  33.17 
 
 		 1017 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  25.91 
 
 		 795 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31 
 
 		 1453 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  56.06 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 225 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  29.97 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  29.88 
 
 		 1656 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.92 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  56.92 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.75 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  51.39 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  50.7 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  26.77 
 
 		 812 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  27.75 
 
 		 642 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  50.82 
 
 		 206 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.85 
 
 		 693 aa  73.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  52.46 
 
 		 209 aa  72.8  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 212 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  31.87 
 
 		 180 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  34.59 
 
 		 1556 aa  71.6  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  30.23 
 
 		 667 aa  71.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  27.14 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  49.28 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.82 
 
 		 894 aa  70.5  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  50.79 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 216 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 213 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  27.7 
 
 		 639 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 270 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.53 
 
 		 241 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 231 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  55.93 
 
 		 119 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  48.61 
 
 		 213 aa  68.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 970 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  53.03 
 
 		 917 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.59 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  47.89 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  50.77 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  46.15 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  46.15 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 544 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  53.33 
 
 		 901 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  27.19 
 
 		 1461 aa  67.8  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  30.23 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>