54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0037 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 346 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  37.5 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  36.54 
 
 		 335 aa  186  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  36.18 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  33.11 
 
 		 280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  34.58 
 
 		 445 aa  99.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  28.38 
 
 		 1557 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1762 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  28.69 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  23.97 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  25.32 
 
 		 795 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  25.16 
 
 		 776 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  23.84 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  23.88 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  35.38 
 
 		 693 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  28 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  28.11 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  28.51 
 
 		 990 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  30.34 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  24.64 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 454 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.49 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  38 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.03 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  29.03 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  29.03 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  29.03 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  36.56 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  37.5 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  24.76 
 
 		 1474 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  25.31 
 
 		 506 aa  52.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  24.62 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1407 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  25.45 
 
 		 1656 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  31.93 
 
 		 497 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  33.33 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  27.36 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.4 
 
 		 2942 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  26.01 
 
 		 317 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  37.8 
 
 		 717 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  38.33 
 
 		 392 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  25.81 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  38.33 
 
 		 392 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  38.33 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  23.58 
 
 		 586 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  24.26 
 
 		 1461 aa  46.2  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  27.04 
 
 		 1556 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  22.63 
 
 		 642 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0451  kelch repeat-containing protein  25.61 
 
 		 418 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  23.93 
 
 		 812 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  27.53 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1514 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 461 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>