42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2044 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  99.23 
 
 
392 aa  788    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  100 
 
 
392 aa  795    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  99.49 
 
 
392 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  44.59 
 
 
380 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  44.33 
 
 
384 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  44.85 
 
 
386 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  44.85 
 
 
386 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.14 
 
 
368 aa  282  9e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.25 
 
 
368 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.14 
 
 
368 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  38.87 
 
 
368 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  38.87 
 
 
368 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  38.87 
 
 
368 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.14 
 
 
368 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1372  N-acetylneuraminic acid mutarotase  37.47 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0355  N-acetylneuraminic acid mutarotase  37.95 
 
 
388 aa  247  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1371  hypothetical protein  32.85 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0722  putative lipoprotein  31.2 
 
 
384 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  31.2 
 
 
383 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  27.07 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  29.79 
 
 
384 aa  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  25.51 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1051  hypothetical protein  27.31 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  40.48 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  27.69 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  25.85 
 
 
883 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3891  hypothetical protein  39.24 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  38.68 
 
 
372 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  25.91 
 
 
327 aa  51.2  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  26.24 
 
 
339 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  25.53 
 
 
336 aa  50.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
850 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  37.66 
 
 
497 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  38.33 
 
 
346 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  25 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  27.45 
 
 
536 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.6 
 
 
693 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  27.45 
 
 
536 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  28.78 
 
 
1656 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  28.03 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  23.7 
 
 
1514 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52303  protein involved in cell fusion and morphogenesis  27.27 
 
 
970 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>