28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1371 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1371  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  730    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1372  N-acetylneuraminic acid mutarotase  37.46 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0355  N-acetylneuraminic acid mutarotase  35.04 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  33.64 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  33.64 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  33.64 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  30.29 
 
 		 380 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.63 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  30 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.34 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  29.34 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  29.34 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  29.34 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.34 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.91 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.91 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  29.06 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  28.07 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  27.35 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1051  hypothetical protein  23.44 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0722  putative lipoprotein  22.84 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  21.93 
 
 		 883 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  22.71 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  25.94 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  24.79 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  24.58 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  22.18 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0451  kelch repeat-containing protein  29.25 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>