27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1051 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1051  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  629  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0722  putative lipoprotein  30.75 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  32.74 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  22.78 
 
 
384 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.78 
 
 
392 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.78 
 
 
392 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.31 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1371  hypothetical protein  23.44 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1372  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.23 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  30.27 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  32.32 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  31.02 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.64 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  31.02 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0355  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.91 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.17 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  26.17 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  26.17 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.17 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  26.17 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  21.21 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.17 
 
 
368 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  21.21 
 
 
883 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  24.48 
 
 
418 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  20.44 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  23.86 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
454 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>