42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2260 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  99.49 
 
 
392 aa  790    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  99.74 
 
 
392 aa  792    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  100 
 
 
392 aa  794    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  44.85 
 
 
380 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  44.59 
 
 
384 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  45.12 
 
 
386 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  45.12 
 
 
386 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.41 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.52 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.41 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  39.14 
 
 
368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  39.14 
 
 
368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  39.14 
 
 
368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.41 
 
 
368 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1372  N-acetylneuraminic acid mutarotase  37.47 
 
 
384 aa  263  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0355  N-acetylneuraminic acid mutarotase  37.05 
 
 
388 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1371  hypothetical protein  32.85 
 
 
356 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0722  putative lipoprotein  31.62 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  31.62 
 
 
383 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  27.44 
 
 
418 aa  94.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  29.79 
 
 
384 aa  89.4  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1051  hypothetical protein  27.78 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  25.51 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  40.48 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  27.69 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  26.58 
 
 
883 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3891  hypothetical protein  39.24 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  38.68 
 
 
372 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  26.24 
 
 
339 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  26.04 
 
 
327 aa  50.8  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  25.53 
 
 
336 aa  50.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
850 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  37.66 
 
 
497 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  38.33 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  25 
 
 
318 aa  46.2  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.6 
 
 
693 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  27.45 
 
 
536 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  27.45 
 
 
536 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  28.78 
 
 
1656 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  28.03 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52303  protein involved in cell fusion and morphogenesis  27.27 
 
 
970 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248654  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  23.9 
 
 
990 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>