15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3891 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3891  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  194  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  93.83 
 
 		 368 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  93.83 
 
 		 368 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  93.83 
 
 		 368 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  93.83 
 
 		 368 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  93.83 
 
 		 368 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  91.36 
 
 		 368 aa  161  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  91.36 
 
 		 368 aa  160  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.24 
 
 		 392 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.24 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  39.24 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  33.77 
 
 		 380 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  33.77 
 
 		 384 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  33.77 
 
 		 386 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  33.77 
 
 		 386 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>