50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1425 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 327 aa  669    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  33.85 
 
 		 353 aa  192  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  32.34 
 
 		 356 aa  165  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 850 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  29.09 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  27.2 
 
 		 418 aa  89.4  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  27.7 
 
 		 883 aa  89.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  25.42 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  22.71 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0722  putative lipoprotein  24.78 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  23.77 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  29.06 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0355  N-acetylneuraminic acid mutarotase  37.61 
 
 		 388 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  28 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  29.17 
 
 		 698 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  30.43 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  28.67 
 
 		 334 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  22.57 
 
 		 471 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  28.57 
 
 		 693 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1372  N-acetylneuraminic acid mutarotase  35.04 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.91 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.91 
 
 		 392 aa  49.7  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.39 
 
 		 392 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 		 812 aa  49.3  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1557 aa  49.3  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  31.39 
 
 		 508 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.63 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.85 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.85 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.85 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.85 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1762 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1407 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.63 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  25.63 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  25.63 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.13 
 
 		 368 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  25.63 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  30.22 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  22.58 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  26.28 
 
 		 180 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.5 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  23.18 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  25.53 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  24.35 
 
 		 993 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  31.08 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  28.78 
 
 		 445 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  24.88 
 
 		 990 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>