36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1887 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 358 aa  721    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  45.25 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  38.87 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  37.5 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  33.8 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  28.05 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1762 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  26.16 
 
 		 776 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1407 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  25.86 
 
 		 812 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  29.67 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  27.49 
 
 		 639 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  26.02 
 
 		 1557 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  27.8 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  28.57 
 
 		 693 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  24.1 
 
 		 312 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  29.82 
 
 		 795 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  30.94 
 
 		 924 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.23 
 
 		 1453 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 		 1556 aa  52.8  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  25.52 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  27.05 
 
 		 646 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  29.84 
 
 		 497 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  23.88 
 
 		 586 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  28.99 
 
 		 536 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  28.99 
 
 		 536 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  23.57 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  27.63 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  28.47 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  25.58 
 
 		 642 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  27.11 
 
 		 717 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.13 
 
 		 1451 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  28.77 
 
 		 506 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  23.27 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>