117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2670 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 812 aa  1636    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  44.84 
 
 		 990 aa  257  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  45.18 
 
 		 795 aa  257  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  53.58 
 
 		 601 aa  256  9e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  41.49 
 
 		 693 aa  231  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  39.8 
 
 		 3802 aa  205  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  37.39 
 
 		 497 aa  190  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  60 
 
 		 970 aa  187  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  57.5 
 
 		 1193 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  53.24 
 
 		 693 aa  141  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  48.59 
 
 		 1236 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  35.88 
 
 		 318 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1762 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  50.76 
 
 		 1069 aa  135  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  50 
 
 		 1424 aa  135  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  35.45 
 
 		 373 aa  130  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  32.09 
 
 		 2706 aa  127  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  33.11 
 
 		 321 aa  125  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  42.36 
 
 		 1206 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  45.99 
 
 		 1392 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  32.77 
 
 		 321 aa  118  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  48.84 
 
 		 1295 aa  117  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  31.72 
 
 		 445 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  32.76 
 
 		 317 aa  112  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  28.87 
 
 		 341 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  28.12 
 
 		 776 aa  103  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  38.89 
 
 		 1193 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  28.99 
 
 		 312 aa  96.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  29.21 
 
 		 993 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  35.68 
 
 		 334 aa  95.5  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  26.16 
 
 		 314 aa  94.7  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  28.46 
 
 		 344 aa  94  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  36.6 
 
 		 1479 aa  93.2  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  27.65 
 
 		 1656 aa  91.3  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  28.93 
 
 		 1017 aa  90.9  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 		 1009 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  28.93 
 
 		 1009 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  30.86 
 
 		 339 aa  88.2  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  33.97 
 
 		 2142 aa  87.4  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 471 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  24.31 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1407 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  27.17 
 
 		 321 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  29.23 
 
 		 1557 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.16 
 
 		 1451 aa  79  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.56 
 
 		 1453 aa  78.2  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  31.01 
 
 		 1687 aa  77  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  30.38 
 
 		 1465 aa  74.3  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  25.42 
 
 		 2942 aa  74.3  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  30.07 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 461 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  30.39 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  37.84 
 
 		 658 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  28.43 
 
 		 180 aa  68.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1514 aa  68.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  25.54 
 
 		 725 aa  68.2  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  25.48 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  36.17 
 
 		 850 aa  67.8  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  29.92 
 
 		 642 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  32.21 
 
 		 1455 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  28.63 
 
 		 698 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1808  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  28.22 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  31.54 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  25.86 
 
 		 358 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  29.93 
 
 		 677 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  25.68 
 
 		 336 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  24.81 
 
 		 717 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  27.65 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  25.27 
 
 		 667 aa  57.4  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  31.76 
 
 		 1108 aa  57.4  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  29.08 
 
 		 396 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  37.38 
 
 		 1736 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  30.47 
 
 		 448 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  27.44 
 
 		 430 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  25.77 
 
 		 557 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2846  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  30.19 
 
 		 624 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  30.04 
 
 		 484 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  31.78 
 
 		 1424 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  31.06 
 
 		 1428 aa  54.3  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  35.83 
 
 		 236 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  34.38 
 
 		 514 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  28.97 
 
 		 377 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  25.37 
 
 		 536 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  25.37 
 
 		 536 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  27.88 
 
 		 646 aa  52.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  29.15 
 
 		 772 aa  52  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  26.87 
 
 		 366 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  27.81 
 
 		 368 aa  52  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2941  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.67 
 
 		 1215 aa  52  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.972596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1258  hypothetical protein  27.01 
 
 		 561 aa  50.8  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  30.4 
 
 		 1303 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  26.04 
 
 		 639 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  23.72 
 
 		 506 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  37.18 
 
 		 483 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0451  kelch repeat-containing protein  24.6 
 
 		 418 aa  48.9  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  25.1 
 
 		 335 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  31.78 
 
 		 631 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  23.33 
 
 		 1245 aa  48.5  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>